Debes cambiar el planteamiento, bajo ningún concepto debes sustituir la base de datos por otra.
Imaginemos que actualizas la app y necesitas añadir una tabla a la base de datos, debes hacerlo en tiempo de ejecución con sentencias SQL, lo mismo si debes añadir un campo a una tabla. No puedes sustituir la base de datos por otra, ya que esto comporta la perdida de información.
básicamente deberás utilizar
CREATE TABLE para crear nuevas tablas
ALTER TABLE para añadir nuevos campos
Un abrazo!!