Buenas tardes, el archivo "clts.txt" como se creo? si se guarda como texto ascii los carácteres no ascii se pierden, tienes que guardar el texto como utf8, me juego un café a que es ese tu problema.
Abre con el note4pad de windows ese archivo y comprueba el texto que contiene, así sabrás si el problema viene de como se guarda el archivo de texto.
También podría ser que la bd de sqlite guarde los datos en las tablas en una codificación diferente a utf8, te recomiendo usar SQlite expert personal, te deja cambiar ese tipo de cosas y es gratuito.