Lo mas sencillo para correr una app en linux es solo compilar el .jar
del lado de linux tienes que tener Java instalado y el modulo de JavaFX y tiene que ser la misma version (java 11) que con la que compilaste.
para que no te sea complicado, no uses los repositorios de Ubuntu, instala un Java que ya tenga el modulo listo. por ejemplo
Download Liberica JDK, supported OpenJDK builds. Open source Java 8, 11 and more for Linux, Windows, macOS.
En esa pagina, selecciona JDK 11, busca linux y selecciona la version FULL
con eso deberia ser suficiente para que puedas correr un jar con UI.